动物在摄食时实际上也是肠道在接受高浓度抗原的刺激，这就会导致机体产生相应的防御反应，包括有局部的免疫系统激活和相应的系统免疫反应。因而不同蛋白源对机体免疫反应的影响包括两个方面，即蛋白源引起全身性免疫反应的变化及引起局部免疫反应，如蛋白质抗原性引起肠粘膜局部过敏反应。EsParza等用以酪蛋白和豌豆作为蛋白源日粮饲喂刚断奶的小鼠和成年鼠，与饲喂酪蛋白相比，饲喂豌豆日粮的鼠生长受阻，其中刚断奶的小鼠更明显，这可能与某种免疫机理有关。刚断奶的小鼠摄食豆类后血清中总免疫球蛋白水平和IgG水平显着增加，小鼠和成年鼠饲喂豆类后，脾脏总T细胞和Th细胞百分比显着增加。饲喂豆类对幼龄鼠生长影响大于成年鼠，可能与其免疫系统的未完全成熟有关。Wong等试验指出，对于小鼠，牛奶乳清蛋白具有较大豆蛋白分离物及绵羊初乳乳清蛋白较强的免疫力增进作用。

　　Parker等比较了酪蛋白、乳清蛋白和大豆蛋白对小鼠注射绵羊红细胞抗原的免疫反应的影响，结果显示不同蛋白质对免疫反应的影响可能与小鼠的营养需求无关，其中乳清蛋白具有最高的免疫反应增强效果。

　　蛋白质抗原性可导致肠道局部免疫系统激活，引起食物过敏和肠组织损伤。大豆蛋白的这一作用在前面已进行了讨论。事实上，牛奶蛋白过敏亦经常发现在新生儿中，不成熟的肠粘膜屏障可能是食物过敏重要原因。Schreiber等指出，新生儿由于肠粘膜屏障不成熟，一些抗原(如微生物抗原、微生物毒素抗原及日粮蛋白质抗原)如允许渗透过肠粘膜，极可能引起炎症和过敏反应，出现胃肠道或全身病态，而肠粘膜的局部免疫反应旨在防止抗原穿过肠腔表面，亦即对该抗原产生全身耐受性。K1einman指出，新生儿对日粮抗原的反应受日粮抗原与母体免疫力互作的影响。由于日粮抗原影响的重要性，Kleinman提出了根据日粮抗原的免疫反应开发低过敏日粮配方的思路。

　　日粮蛋白质抗原的作用机理尚不十分明确，它可能同时影响系统免疫反应和局部免疫反应。进入肠道的日粮蛋白抗原通常有极小一部分(<0.002％)被完整吸收(Swarbrick等)，而刺激产生血清抗体免疫反应(Lippard等)，但当这种系统抗体反应随后被抑制时(Thoma s和Parrott)，局部的粘膜抗体反应则继续存在，这与降低随后的抗原吸收的特异性能力的发育有关，即与免疫排斥的形成有关(Swarbick等)，血清抗体的下降与口腔耐受性的成熟有关。一些研究者指出，在小鼠给饲喂接触性致敏物(A sherson等)、红细胞(Kagnoff)和可溶性蛋白质(Stokes等)后，机体产生迟发型过敏反应，其随后被抑制。Stokes等研究指出，在大肠杆菌的大量繁殖和断奶腹泻形成之前，肠道免疫系统就对日粮抗原产生了短暂的过敏反应，这种反应导致了肠细胞周转加快和绒毛萎缩，而这种反应为细胞介导的免疫反应。它增加了对疾病的易感性。因此根据以上研究可以看出，日粮蛋白质抗原所引起的过敏反应可能为细胞介导的迟发型过敏反应。Host等指出，牛奶蛋白过敏反应主要由一类免疫反应(IgE一介导)引起，但也有证实可能与第三类(免疫复合物)与第四类(细胞介导)有关，与早期断奶相关的肠道组织学变化包括隐窝增生、绒毛萎缩以及吸收不良等是对断奶日粮中抗原的短暂免疫反应的结果，这已被Miller等所证实。日粮抗原和微生物抗原在对肠道免疫系统的反应方面，两者相互影响。综上所述，食物过敏及日粮抗原过敏反应卞要可能的机制是I型过敏反应与IV过敏反应，这为我们提供了解决问题的依据。