有些特殊物料的营养含量变小了，如鸡粪发酵中由于添加了大量的秸秆粉或粗糠粉作为疏松剂来发酵，所以发酵后，粗蛋白、粗灰份、钙、磷含量都变小了。鸡粪粗蛋白虽然降低了，但可消化蛋白含量却会增加。另外，当血粉蛋白含量达80%，也由于发酵时加入了玉米配料，所以蛋白也降低了几个百分点，但营养价值却是提高了。

其实酱油渣里的含盐量是非常高的，需要加大量的其他物料来中和盐份才可以发酵。技术人员在对酱油渣的实验中发现，加了秸秆粉，所以酱油渣的蛋白也降低了，但实际上营养价值却提高了。这是由于蛋白可消化率和能量利用率提高了，粗纤维降低，并且清除了饲料中的有害细菌等各方面的综合因素才是决定营养价值的因素，尤其是血粉，蛋白质虽然从78.95%下降到了74.58%，但可消化蛋白却从21.01%，提高到了56.75%，增加了近三倍。