对这一疫情专家都还没有一致的看法，目前主要的观点有以下几种：

　　一是认为由于猪流行性腹泻病毒（PEDV）变异的结果。国内几家权威实验室的检测结果都表明猪流行性腹泻病毒在病料中所占的比例超过60%，而且进一步基因测序表明新分离的毒株相对于疫苗毒株已经发生较大变异，疫苗的保护效果可能已经不好。这种说法有一定道理，但是很多依照正确程序进行反饲的PEDV阳性猪场依然发病很严重，甚至整窝仔猪都会发病，所以这种说法不够全面。

　　二是认为是霉菌毒素中毒的表现。其主要依据是不少新生仔猪的胃黏膜已经脱落，并且存在肝脏病变，所以怀疑是霉菌毒素通过胎盘屏障损害了仔猪消化道。但是一方面母猪并没有厌食、阴户红肿等典型的霉菌毒素中毒表现，另一方面如果真的是霉菌毒素的危害，那么高温高湿的夏季应该成为新生仔猪腹泻的高发季节，但是事实正好相反，所以这种说法并不正确。

　　三是认为这是新的病毒（如博卡病毒、脊病毒等）造成的。但是一方面回归实验并没有证实这些病毒对猪有毒性，另一方面合理的反饲同样难以避免疫情的发生。

　　结合临床诊疗经验，认为真实的原因应该是猪流行性腹泻病毒变异，毒力变强，而仔猪的消化道在出生3天内又缺乏抵抗力，两方面因素共同导致了这两场腹泻疫情大流行。由于猪的胎盘结构是上皮绒毛膜胎盘，母源抗体在妊娠期根本无法进入仔猪体内。于是仔猪只能在吃母乳过程中获得母源抗体，母源抗体又包括I克G和I克A，获得顺序为出生前3天主要获取I克G用来抵抗全身感染，出生3天后主要获取I克A，实现局部黏膜免疫。只有I克A才能形成对肠道黏膜的保护。也就是说其实出生3天内仔猪可以抵抗全身感染，但是肠道黏膜保护力几乎为0，难以抵抗肠道病原对于肠道黏膜的侵袭。流行性腹泻病毒的自然潜伏期为5天，变异后病毒毒力增强，在大流行时部分易感猪发病，猪场分娩舍充满了流行性腹泻特有的一种腥臭味，也就说空气中漂浮着很多PEDV病毒颗粒，仔猪一出生就被感染大量病毒，潜伏期缩短，3天时就大量繁殖，抢先一步占据大部分肠道细胞，进而猪出现剧烈腹泻进而脱水死亡。总之，猪独特的获取抗体方式中存在的缺陷再加上猪流行性腹泻病毒变异毒力增强导致了新生仔猪腹泻疫情。

　　因而我们一切工作的核心都应该是保证仔猪出生3天内不被病毒感染，同时尽早建立起抵抗猪流行性腹泻病毒的I克A肠道屏障。具体措施如下：

　　第一，及时隔离发病猪，加强产房消毒（宜用生石灰等），减少空气中漂浮的PEDV颗粒，必要时可以在妊娠舍设立临时的分娩室，待仔猪出生3天后才转入分娩舍，总之降低仔猪承受的感染压力。第二，母猪产前40天交巢穴接种猪传染性胃肠炎-流行性腹泻二联苗，20天后加强一次，一些发病猪场还可以在产前30天反饲病猪胃肠组织，连续7天，这些都有助于促进母猪产生抗PEDV抗体。第三，产前20天～30天时在每吨哺乳母猪料中加入奥来可1公斤+中威聚能星500克，一直用到断奶，促进营养吸收，增加母源抗体总量。第四，定期使用中威银翘散保健（2公斤拌料1吨），解除母猪亚健康，增加母源抗体总量。第五，小猪出生后尽快吃初乳。第六，加强围产期保健，降低继发感染压力，推荐方案：雅博25克+利呼宁10克+聚能星5克/头*天，分娩前后各用5天。

　　对已经发病仔猪可以紧急注射猪瘟细胞苗10头份+力神5毫升/头；使用口服补液盐溶液或腹腔补充葡萄糖生理盐水90毫升/头*天（每天分3次补充）对病猪补充体液。