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2005年，中央财政开始实施奶牛良种补贴试点项目，并于2009年启动了肉牛良种补贴项目，由全国畜牧总站负责组织实施。
截至2011年，中央财政共安排奶牛肉牛良种补贴资金13.35亿元，累计改良奶牛4280.5万头（次），改良肉牛1000万头（次）；共遴选推荐乳用种公牛5764头、肉用种公牛1774头。据初步测算，全国奶牛平均单产水平提高40%，增幅近1500公斤；良种补贴后代牛出生重比地方品种同龄牛重5公斤~8公斤，6月龄~12月龄同期育肥体重提高25%以上。
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