冬季猪舍的清粪时间要安排在舍内外温差变小接近中午的时段，而且要先开窗通风，然后再开始清粪，这也是因为通风需要一个由小到大开窗的过程；如果在天气合适的日子，下午用水冲洗一下网床下面，然后通风晾干，可以保证一晚上猪呼吸到新鲜空气，对预防呼吸道病是非常有利的。
    利用定位栏清理粪便比较容易，在夏季可以水冲的情况下更好操作；但在冬季不能水冲时则需要讲究清粪的方法，否则会出现猪黑屁股。清粪方法：每次喂料的同时，将水关掉，添完料后马上清粪，先将粪便刮到定位栏外，待大部分粪便清理后，打开阀门放水，这样有保持舍内干燥的功效。因为猪一般在没有喝水的情况下不会轻易躺下，使我们的工作变得轻松。
    产房仔猪腹泻的最大危险来自大肠杆菌，而母猪粪便是大肠杆菌的滋生地，如果子猪不与母猪粪便接触，患病的可能会小得多，所以也就出现了部分猪场实行母猪接粪的做法，也就是粪便不与网床接触由人接住。许多人认为这样工作量很大，没有时间这样干，但仔细考虑，是可以操作的，不一定每头猪都接，但一部分猪是可以的，而且接粪减少了粪便落地后的清理刷洗，关键是要掌握好操作程序。最佳办法是每次喂料前，先将料拌成湿料，猪听见拌料声会起立等待，这时先不去喂料，而是拿粪锹在母猪后面转，发现哪个母猪有拉粪的迹象，马上跑去将粪便接住，这样十到二十分钟，大部分母猪都会排便，然后再开始喂料。