消毒工作是畜禽传染病防控的主要手段之一，各级动物防检机构和所有养殖场对此要高度重视。笔者根据多年的实践经验，将其要点阐明如下。
保证消毒效果消毒目的要明确因为消毒目的不一样，所使用的消毒药也不一样；所要稀释的浓度不一样，采用的消毒方法也不一样。
先将环境清洁后再进行消毒这是保证消毒效果的前提和基础，因为畜禽的排泄物、分泌物、灰尘、粪便和污物等有机物，不仅可阻隔消毒药，使之不能接触病原体，而且有机物还能与许多种消毒药发生化学反应，明显地降低消毒药物的药效。
选择消毒药物要准确和注重效果有选择地确定消毒目的，如想杀灭病毒，则选择杀灭病毒的消毒药；如想杀灭某些病原菌，则选择杀灭细菌的消毒药。许多情况下，还要将杀灭病毒和细菌甚至真菌、虫卵等几者兼顾考虑，选择抗毒抗菌谱广的消毒药，这样才能做到有的放矢。同时，应根据消毒目的，是平时预防性的，还是扑灭正在发生的疫情，或周围正处于某种疫病流行高峰期而本养殖场受到威胁时的消毒，以此来选择药物的稀释浓度，以保证消毒的效果。
药物的配制和使用的方法要合理目前，许多消毒药是不宜用井水稀释配制的，因为井水大多为含钙、镁离子较多的硬水，会与消毒药中释放出来的阳离子、阴离子或酸、碱离子发生化学反应，从而使药效降低。因此，在稀释消毒药时一般应使用自来水或白开水。
药物应现用现配，配好的消毒药应一次用完许多消毒药具有氧化性或还原性，还有的药物见光遇热后分解加快，须在一定时间内用完，否则，很容易失效而造成人力物力的浪费。因此，在进行配制消毒药时，应认真根据药物说明书和要消毒的面积来测算用量，尽可能将配制的药液在完成消毒面积后用完。稀释好的药液不宜久储，一般当天用完为好。
必须注意消毒药的理化性质
注意消毒药的酸碱性酚类、酸类两大类消毒药一般不宜与碱性环境、脂类和皂类物质接触，否则明显降低其消毒效果。反过来，碱类、碱性氧化物类消毒药不宜与酸类、酚类物质接触，防止其降低杀菌效果。酚类消毒药一般不宜与碘、溴、高锰酸钾、过氧化物等配伍，防止化学反应发生而影响消毒效果。
注意消毒药的氧化性和还原性氧化物类、碱类、酸类消毒药不宜与重金属、盐类及卤素类消毒药接触，防止发生氧化还原反应和置换反应，不仅使消毒效果降低，而且还容易对畜禽机体产生毒害作用。
注意消毒药的可燃性和可爆性氧化剂中高锰酸钾不宜与还原剂接触，如高锰酸钾晶体在遇到甘油时可发生燃烧，在与活性炭研磨时可发生爆炸。
注意消毒药的配伍禁忌重金属类消毒药忌与酸、碱、碘和银盐等配伍，防止沉淀或置换反应发生。
表面活性剂类消毒药中，阳离子和阴离子表面活性剂的作用互相抵消，因此不可同时使用；表面活性剂忌与碘、碘化钾和过氧化物等配伍使用，不可与肥皂配伍。
使用消毒药要避免人畜受到危害
1.强酸类、强碱类及强氧化剂类，对人畜均有很强的腐蚀性，因此，在使用这几类消毒药消毒过的地面、墙壁等最好用清水冲刷之后，再将动物放进来，防止灼伤动物（尤其是幼畜）。
2.凡实施熏蒸消毒时，其产生的消毒气体和烟雾，均对人畜有毒害作用，就是熏蒸后遗留的废气，对人畜的眼结膜、呼吸道黏膜均会造成伤害，故必须将废气彻底排净后，方可放进畜禽；带畜禽消毒时不宜选择熏蒸消毒。
3.凡有毒的消毒药均不能进行饮水消毒：酚类、酸类、醛类和碱类消毒药，均具有不同程度的毒性。因此，这几类消毒药不宜用于饮水消毒，也不宜使用这几类消毒药来消毒肉品（过氧乙酸除外）。
4.用作饮水消毒的消毒药其配制浓度要准确。能用作饮水消毒的消毒药主要有卤素类、表面活性剂和氧化剂类等几类消毒药中的大部分品种。但其配制浓度很重要，浓度高了则会对动物机体造成损害或引起中毒，浓度低了起不到消毒杀菌的作用。
消毒药应定期更换
使用任何消毒药，在一个地区、一个畜禽场都不宜长期使用。因为动物机体对几乎所有的药物（当然包括消毒药）都会产生抗药性。长期使用单一的消毒药，容易使动物体内及饲养场内外环境中的病原体，由于多次频繁地接触这种消毒药而形成耐药菌株，其对药物的敏感性下降甚至消失，使药物对这些病原体的杀灭能力下降甚至完全无效，致使疫病发生和流行。
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