干草贮存时，一般要求干草的水分含量达到14％～17％，才可以上垛或打包贮存，在我国北方干燥地区可以在水分含量为17％的限度内贮存，而在南方空气潮湿地区则应以水分含量不超过14％为宜。在这样限度内贮存的干草，营养成分的损失可以降到最低限度。由于种种原因，干草上垛贮存时水分含量往往在20％以上甚至30％，这些多余水分将留在上堆以后逐渐干燥，因此，垛上千草中的化学变化也就不能完全停止。微生物与植物本身的酶还会继续起作用。干草贮存过程中的变化如下：

 1、氧化过程使植物的叶绿素脱镁而变成脱镁叶绿素，使干草失去应有的青绿色泽，变为微黄或褐色。在营养物质氧化降解过程中，部分六碳糖与氨基酸或蛋白质结合，形成褐色聚合物，使干草变为暗褐色，此情况在超过32℃以上的高温过程中常见到。另外发酵过程可以赋予干草一定的香味，这是褐色干草的缺点。

 2、如果草堆中由于氧化过程中升温超过40℃，甚至高达70℃时，由于微生物作用的结果还会产生许多挥发性易燃的气体，因此，如有空气透入或因解堆，常可引起火灾。

3、干草一半以上的损失是在贮藏过程中发生的，主要是微生物的活动使草捆发热、发霉造成的。在贮存条件较好的仓库中，由贮藏引起的干草干物质损失量约为5％左右，以胡萝卜素的含量下降得最快。干草贮藏于室外所造成的损失主要由风化引起，风化可以减少干草的饲喂价值15％-25％，以草捆形式堆放一年干物质损失为5％-30％，而比较松散的草堆干物质损失超过15％ 。贮藏良好的干草，即使经过几年的时间，其营养物质的消化率并无明显的变化，但胡萝卜素的保存时间不能太久。草原干草贮存三年过程中各阶段样品的消化率如表1所示。

表1  草原干草贮存三年过程中各阶段样品的消化率(单位：％)

  干草的贮存方式与营养损失也有关系，美国研究人员研究了苜蓿干草在露天堆成垛和打成大捆压实保存对干草的保存期限和质量的影响，结果表明，堆成垛的干草前7个月化学变化不明显，而营养物质损失超过10％，7个月后，干草的营养物质含量，特别是粗蛋白质和胡萝卜素含量均急剧下降；而打成大捆压实保存的干草这种变化不明显。